第十六屆『天元賽』初賽將於2017年1月3日(二)上午十點在台灣棋院舉行(開賽前先舉行新科職棋授證儀式，授證後隨即開賽)，參加本屆初賽的棋士共計53位。比賽規則採比目法，一律分先，黑貼6.5目；初賽用時每人各2小時，最後3分鐘讀秒，60秒3次。由於複賽保留者之一林至涵九段棄權，因而第十六屆天元賽初賽將自初賽參賽者中依獎金排名取13名為種子，最後取13名進入複賽，種子名單為：
周俊勳九段、林士勛五段、蔡丞韋三段、賴均輔二段、周尹南五段
陳 鋒四段、林修平六段、陳 禧三段、張哲豪五段、劉耀文五段
周平強六段、夏大銘六段、黃彥誠三段
初賽籤號及1月3日(二)首場對戰組合及賽程表如下：
1 周俊勳九段輪空
2 范揚波三段輪空
3 黃世元初段 VS. 4許育祺二段
5 蔡丞韋三段輪空
6 趙佩哲三段輪空
7 王智弘初段 VS. 8張凱馨五段
9 黃彥誠三段輪空
10 高 昀三段 輪空
11周序鋒六段 VS. 12蕭愛霖二段
13林士勛五段輪空
14盧奕銓初段輪空
15楊志德五段 VS. 16彭景華七段
17夏大銘六段輪空
18董友棠初段輪空
19許長正二段 VS. 20陳逸達五段
21陳 鋒四段 輪空
22陳擎宇二段輪空
23陳義翔四段 VS. 24魏豪廷二段
25陳 禧三段 輪空
26陳秋龍三段輪空
27余炳葟初段 VS. 28林宇翔五段
29劉耀文五段輪空
30劉建昌二段輪空
31周可平六段 VS. 32黃丞毅三段
33賴均輔二段 輪空
34張正平三段輪空
35林杰漢二段VS. 36林庭毅二段
37周平強六段輪空
38蘇聖芳三段 輪空
39葉紘源三段 VS. 40黃祥任六段
41林修平六段輪空
42楊子萱初段輪空
43張懷一三段 VS. 44陳威廷初段
45周尹南五段輪空
46林彥丞初段輪空
47戴嘉伸七段 VS. 48楊孟允四段
49張哲豪五段輪空
50黨希昀二段輪空
51丁少傑三段輪空
52林世民二段 VS. 53李晶彬初段
第十六屆『天元賽』初賽賽程表如附：
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